Шестнадцать лет назад таинственный ниндзя в маске выпустил на свободу мощное существо, известное как Девятихвостовая Лись-Демон на Скрытом Листе деревни Коноха, убив много людей. В ответ лидер сил ниндзя Конохи, Четвертый Хокаге Намикадзе Минато, и его жена Узумаки Кушина, живая тюрьма демона Фокса, запечатывают существо внутри своего новорожденного сына Узумаки Наруто. После того, как Хвостовой Зверь был опечатан, все продолжалось как обычно. Однако в наши дни мир заканчивается, когда группа ниндзя под руководством Тоби, таинственного человека в маске, стоящего за неистовством Девятиххвостовой Лисы, который намеревается осуществить свой план по управлению миром, окутав его иллюзиями, называется атакой Акацуки Коноха. Наруто и Сакура подчиняются Гендзюцу Тоби, приведенному в альтернативный мир, где у многих из них есть противоположные личности, узнав, что родители Наруто живы в этом мире, а родители Сакуры мертвы.