В то время, когда треть человечества была уничтожена врагом, известным как Черви, человечеству пришлось прибегнуть к использованию оружия массового поражения, чтобы победить. Но только 10 лет спустя черви вернулись. И только несколько особенных девушек, Sky Girls, которые пилотируют большие механические рамы под названием Sonic Divers, имеют шанс повлиять на исход этого нового конфликта.